中国医科大学学报  2018, Vol. 47 Issue (4): 341-345

文章信息

邵洋, 胡延平, 刘勇
SHAO Yang, HU Yanping, LIU Yong
慢性淋巴细胞白血病患者长链非编码RNA RP5-180C18.1的表达及其预后评价作用
Long Non-coding RNA RP5-180C18.1 Expression and Its Prognostic Significance in Patients with Chronic Lymphocytic Leukemia
中国医科大学学报, 2018, 47(4): 341-345
Journal of China Medical University, 2018, 47(4): 341-345

文章历史

收稿日期:2017-04-05
网络出版时间:2018-04-09 11:15
慢性淋巴细胞白血病患者长链非编码RNA RP5-180C18.1的表达及其预后评价作用
邵洋1 , 胡延平2 , 刘勇1     
1. 中国医科大学附属盛京医院 检验科, 沈阳 110004;
2. 中国医科大学附属盛京医院 血液研究室, 沈阳 110004
摘要目的 分析慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者长链非编码RNA RP5-180C18.1的表达及其在CLL的诊断及预后中的作用。方法 收集本院就诊的CLL患者骨髓液并对患者进行随访,采用qPCR方法检测RP5-180C18.1的相对表达量。结果 与对照组比较,RP5-180C18.1在CLL患者高表达(P=0.013);与IGHV突变型CLL患者比较,RP5-180C18.1在IGHV野生型CLL患者中表达更高(P=0.023);与ZAP70低表达CLL患者比较,RP5-180C18.1在ZAP70高表达CLL患者中表达更高(P=0.002);然而,RP5-180C18.1在CD38高、低表达患者中无统计学差异(P=0.206);RP5-180C18.1高表达CLL患者预后更差,总生存期及无进展生存期更短(P分别为0.048、0.041)。结论 RP5-180C18.1表达可作为CLL诊断及预后分析指标。
Long Non-coding RNA RP5-180C18.1 Expression and Its Prognostic Significance in Patients with Chronic Lymphocytic Leukemia
SHAO Yang1 , HU Yanping2 , LIU Yong1     
1. Department of Laboratory Medicine, Shengjing Hospital, China Medical University, Shenyang 110004, China;
2. Department of Hematology, Shengjing Hospital, China Medical University, Shenyang 110004, China
Abstract: Objective To investigate the differential expression of RP5-180C18.1 in chronic lymphocytic leukemia (CLL) and to explore its role in the diagnosis and prognosis of CLL.Methods Bone marrow samples of patients with CLL from Shengjing Hospital of China Medical University were collected and analyzed. The relative expression of RP5-180C18.1 was detected by qPCR and analyzed statistically.Results The expression of RP5-180C18.1 in patients with CLL was higher than in healthy controls (P=0.013) and higher in patients with wild-type IGHV CLL (P=0.023) than in those with the IGHV mutation. The expression was also higher in patients with ZAP70 up-regulation CLL (P=0.002) than ZAP70 down-regulation CLL, although no difference was found in patients with CD38 up-regulation CLL compared with CD38 down-regulation CLL. Patients with RP5-180C18.1 up-regulation CLL showed a poor prognosis, including low overall survival rates and low progression-free survival (P=0.048, 0.041).Conclusion RP5-180C18.1 can be used for the diagnosis of CLL and for the analysis of its prognosis.

慢性淋巴细胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,CLL)是成熟样B淋巴细胞在外周血、骨髓、淋巴结和脾脏大量蓄积为特征的低度恶性肿瘤。CLL在欧美较为常见,而在我国相对少见。目前对CLL的诊断主要依赖于WHO标准[1],依据白细胞计数、血涂片免疫表型等对CLL进行诊断,目前CLL治疗参考NCCN指南[2],需要根据患者年龄、细胞遗传学等分层治疗,预后判断参考Rai和Binet标准[3-4],这两个传统标准主要依赖于体检及血细胞计数来判断预后,并不能充分满足患者需要。近年来一些分子生物学指标(IGHV、ZAP70、17p-和11q-等)也参与CLL的诊断治疗及预后判断[5]。为弥补缺陷,CLL-IPI (CLL international prognostic index)积分系统纳入了TP53缺失/突变、IGHV突变、血清β2-微球蛋白、临床分期和年龄5个指标辅助CLL患者的预后判断[6]

长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)是一类本身不编码蛋白、转录本长度超过200 nt的长链非编码RNA分子,它可在多层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)调控基因的表达[7]。非编码RNA的异常表达可以辅助CLL的诊断及预后分层,已有研究证明,多种miRNA及LncRNA在CLL的发生发展中起到重要作用,miR-155提高BCR受体的敏感性,其高表达预示着较差的预后[8],而与之相反,miR-150降低BCR受体的敏感性[9],同时,也有多种lncRNA的下调被认为参与肿瘤的生成,包括HOTAIR、MALAT1和SChLAP1等[10]。本研究前期通过二代测序技术筛选CLL患者中相对于健康人B淋巴细胞中lncRNA的异常表达,结果发现超过20 000种lncRNA存在异常表达,其中RP5-180C18.1存在显著上调(P < 0.001),提示RP5-180C18.1可能在CLL的发生发展中起一定的作用。本研究分析RP5-180C18.1的表达,探讨其在CLL诊断及预后判断上的作用。

1 材料与方法 1.1 研究对象

收集2006年1月至2017年1月本院血液科就诊的初诊CLL患者,采用样本库中留存的临床废弃骨髓样本60例,其中男性27例,女性33例,中位年龄65岁。并采自30例造血干细胞移植供者骨髓液为健康对照。所有患者经过形态学、免疫分型、细胞遗传学及分子生物学综合确诊,实验室特点见表 1,诊断标准参照WHO标准。本实验经过中国医科大学伦理委员会批准(No. 2016PS352K)。根据相关分子生物学指标,分别根据IGHV突变、CD38及ZAP70对CLL患者进行分组比较。并对60例CLL患者进行了随访。

表 1 CLL患者实验室特征 Tab.1 Laboratory features of the chronic lymphocytic leukemia (CLL) and control groups
Variables Control group (n = 30) CLL group (n = 60) P
Male/female 14/16 27/33 0.529
Age (year) 59 (23-79) 65 (28-87) 0.103
Leukocytes (1×109/L) 8.63±0.92 18.5±2.66 < 0.001
Hemoglobin (g/L) 141.54±15.27 127.79±17.83 0.005
Platelets (1×109/L) 194.01±18.34 121.9±14.12 < 0.001
Prolymphocyte (1×109/L) NA 6.1±0.73 NA
NA,not applicable.

1.2 方法

1.2.1 试剂及引物

淋巴细胞分离液Lymphoprep (中国达科公司),逆转录采用RrimeScript RT reagent Kit逆转录试剂盒(日本TaKaRa公司)。实时采用SYBR Green试剂盒(日本TaKaRa公司)。引物为RP5-180C18.1,F:GCAGCGTCCAGAGGCTGG,R:GGCAGCGAGGATGCTGAACC;TBP,F:CCACGGTGAATCTGTGCT,R:GGAGTCGTCCTCGCTCTT。

1.2.2 qPCR检测

采用淋巴细胞分离液分离骨髓单个核细胞,然后Trizol-氯仿方法提取细胞总RNA,Oligo dT法进行反转录反应,以管家基因TBP为内参,同时进行RP5-180C18.1和TBP的实时反应。实时反应设置3个复孔,得出Ct均值,以正常人为对照,应用ΔΔCt相对定量法分析RP5-180C18.1表达水平的差异。ΔΔCt=ΔCt实验组-ΔCt对照组,ΔCt=Ct RP5-180C18.1-Ct TBP,2-ΔΔCt即为基因表达差异的倍数。

1.3 统计学分析

应用SPSS 17.0进行统计学分析。计量资料采用x±s表示。计量资料比较采用独立样本t检验,计数资料比较采用χ2检验,预后分析采用log-rank检验。P < 0.05 (双向)为差异有统计学意义。

2 结果 2.1 RP5-180C18.1在不同CLL表型中的表达

结果显示,与健康对照组(1.894±0.62)比较,RP5-180C18.1在CLL患者(12.93±2.98)表达较高(P= 0.013)。与突变型CLL患者(0.505±0.07)比较,IGHV野生型CLL患者(4.682±1.08) RP5-180C18.1表达高(P= 0.023);与ZAP70高表达CLL患者(0.262±0.04)比较,ZAP70低表达CLL患者(1.728±0.42) RP5-180C18.1表达较高(P= 0.002);CD38低表达(1.162±0.31)与高表达(2.183±0.67) CLL患者RP5-180C18.1表达差异无统计学意义(P= 0.206)。

2.2 RP5-180C18.1表达与CLL分型相关分析

将60例CLL样本根据RP5-180C18.1相对表达量的中位数(2.863)进行分组[RP5-180C18.1低表达组(< 2.863)和RP5-180C18.1高表达组(> 2.863)],分析CLL患者临床特征、分型与RP5-180C18.1表达相关性。结果显示,RP5-180C18.1表达与CLL患者性别、年龄、血红蛋白含量及幼稚淋巴细胞比例无关(P分别为0.604、0.128、0.133、0.058);RP5-180C18.1高表达组CLL患者的白细胞计数较低(P < 0.001),血小板含量较高(P < 0.001)。根据分子生物学特征分组结果显示,RP5-180C18.1表达与CD38表达无关(P= 0.796);RP5-180C18.1高表达组CLL患者ZAP70表达率较高(P= 0.019),野生型IGHV比例较高(P= 0.030)。见表 2

表 2 RP5-180C18.1表达与CLL患者临床特征、分型的相关分析 Tab.2 Correlation analysis of RP5-180C18.1 expression and the clinical features and phenotyping of patients with chronic lymphocytic leukemia
Variables RP5-180C18.1 low expression(n = 30) RP5-180C18.1 high expression(n = 30) P
Male/female 18/12 15/15 0.604
Age(year) 64(28-81) 67(30-87) 0.128
Leukocytes(×109/L) 20.82±2.05 14.27±1.22 < 0.001
Hemoglobin(g/L) 128.65±12.21 123.42±14.3 0.133
Platelets(×109/L) 109.13±10.31 124.7±9.15 < 0.001
Prolymphocyte(×109/L) 6.3±0.48 5.7±0.44 0.058
ZAP70 [n(%)] 0.019
  Negative 19(63.3) 9(30.0)
  Positive 11(36.7) 21(70.0)
CD38 [n(%)] 0.796
  Negative 15(50.0) 13(43.3)
  Positive 15(50.0) 17(56.7)
IGHV [n(%)] 0.030
  Wild type 19(63.3) 27(90.0)
  Mutant type 11(36.7) 3(10.0)

2.3 RP5-180C18.1表达与CLL患者预后相关分析

对60例CLL患者随访结果显示,中位总生存期(overall survival,OS) 93个月,中位无进展生存期(progression-free survival,PFS) 75个月。RP5-180C18.1低表达组中位OS 98个月,RP5-180C18.1高表达组中位OS 39个月,两者具有统计学差异(P= 0.048),见图 1A,RP5-180C18.1高表达CLL患者OS更短。如图 1B所示,RP5-180C18.1低表达组中位PFS 81个月,RP5-180C18.1高表达组中位PFS 25个月,两者具有统计学差异(P= 0.041),RP5-180C18.1高表达的CLL患者PFS更短。RP5-180C18.1高表达组预后相对于RP5-180C18.1低表达组更差。

A, overall survival of patients with chronic lymphocytic leukemia (CLL) according to RP5-180C18.1 expression; B, progression-free survival of patients with CLL according to RP5-180C18.1 expression. 图 1 根据RP5-180C18.1表达量对CLL患者进行的Kaplan-Meier生存分析结果 Fig.1 Kaplan-Meier survival curves of patients with CLL according to RP5-180C18.1 expression

3 讨论

RP5-180C18.1位于1号染色体,编码一段596 bp的转录本,基因ID为ENST00000413901,本研究发现lncRNA RP5-180C18.1在CLL不同表型中存在差异性表达,并且发现其在CLL诊断及预后判断具有辅助作用。结果显示RP5-180C18.1在CLL患者中相对于健康对照存在高表达,提示RP5-180C18.1有作为检测CLL诊断学标志物的潜力。已有研究证明,lncRNA在肿瘤中存在显著差异性表达,可以作为生物标志物辅助肿瘤检测。有研究[11]证明在患者尿液样本中检测lncRNA PCA3可以比前列腺特异性抗原更敏感更特异诊断前列腺癌。血清中检测rp11-445h22.4发现其在乳腺癌组织中高表达,并且具有92%敏感性和74%特异性,显著优于常规生物标志物(CEA、CA125、CA153、AFP) [12]。另外,在胃癌患者体液样本中检测lncRNA tincr,ccat2,aoc4p,bancr,linc00857,aa174084和H19发现,这些lncRNA可以有效鉴别胃癌患者与健康人,并且可以判断胃癌发展的阶段[13]。需要注意的是,本研究对照组设置相对于实验组在参数(幼稚细胞比例及血常规)上存在统计学差异,但这并不违背统计学原理,本研究目的是探索RP5-180C18.1作为CLL生物学标志物的潜力,需要把CLL从健康人中鉴别出来,因此必须采用健康人群作为对照,而幼稚细胞数及血常规指标正是CLL的常见异常。外周血标本来源便捷,临床上最理想的检测标志物采用外周血指标,但是因为标本收集受限,本研究未检测外周血RP5-180C18.1含量,本研究骨髓检测RP5-180C18.1表达可靠,同时期待应用于临床CLL诊断,后续将进一步完善外周血RP5-180C18.1表达检测。

对CLL患者随访分析结果显示,RP5-180C18.1高表达患者具有更差的预后。研究[14]证明lncRNA在肿瘤预后判断起重要作用,lncRNA CCAT2在多种肿瘤(结肠癌、前列腺癌和甲状腺癌等)中过表达,并且预示着较差预后。也有研究[15]认为treRNA降低CLL中DNA损伤,其高表达预示着较差预后。本研究发现RP5-180C18.1在野生型IGHV和ZAP70高表达CLL患者中表达更高,这是否与RP5-180C18.1高表达CLL患者预后较差有关尚未证实,需进一步研究。研究[16]证明IGHV未突变型或ZAP70高表达CLL患者具有较差预后,这也从另一方面支持本研究结果。

综上所述,lncRNA RP5-180C18.1在CLL中高表达,与CLL侵袭性表型相关,并且其高表达具有较差预后。今后应对RP5-180C18.1表达深入研究,为阐明CLL的发病机制提供科学依据。

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