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  北京化工大学学报(自然科学版)  2019, Vol. 46 Issue (6): 45-50   DOI: 10.13543/j.bhxbzr.2019.06.007
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引用本文  

盛浩原, 苑金磊, 刘长霞. 动态反应釜制备超顺磁性Fe3O4粒子及其DNA提取[J]. 北京化工大学学报(自然科学版), 2019, 46(6): 45-50. DOI: 10.13543/j.bhxbzr.2019.06.007.
SHENG HaoYuan, YUAN JinLei, LIU ChangXia. Fabrication of superparamagnetic fe3o4 particles in a dynamic reaction kettle and their application in dna extraction[J]. Journal of Beijing University of Chemical Technology (Natural Science), 2019, 46(6): 45-50. DOI: 10.13543/j.bhxbzr.2019.06.007.

基金项目

厦门市产学研协同创新及科技合作项目(3502Z20172020)

第一作者

盛浩原, 男, 1994年生, 硕士生.

通信联系人

刘长霞, E-mail: liucx@mail.buct.edu.cn

文章历史

收稿日期:2019-02-25
动态反应釜制备超顺磁性Fe3O4粒子及其DNA提取
盛浩原 , 苑金磊 , 刘长霞     
北京化工大学 生命科学与技术学院, 北京 100029
摘要:使用动态反应釜制备得到磁性粒子,与静态反应釜相比单次制备量提高20倍;通过扫描电子显微镜(SEM)、傅立叶红外光谱(FT-IR)、X射线衍射(XRD)、振动样品磁强计(VSM)等手段对产物进行表征,证明获得了粒径200 nm左右的单分散Fe3O4粒子,并具有超顺磁性;对其表面进行SiO2包覆,获得具有良好分散性的Fe3O4@SiO2粒子。研究发现Fe3O4@SiO2对DNA提取具有可重复利用性,并且质粒DNA吸附到Fe3O4@SiO2上后可直接加入聚合酶链式反应(PCR)体系作为扩增模板。
关键词动态反应釜    超顺磁性Fe3O4粒子    Fe3O4@SiO2    DNA提取    重复利用    
Fabrication of superparamagnetic Fe3O4 particles in a dynamic reaction kettle and their application in DNA extraction
SHENG HaoYuan , YUAN JinLei , LIU ChangXia     
College of Life Science and Technology, Beijing University of Chemical Technology, Beijing 100029, China
Abstract: Monodispersed 200 nm superparamagnetic Fe3O4 particles have been prepared in a dynamic reaction kettle under optimized conditions, giving a product yield 20 times that of a static reaction. The product was characterized by SEM, FT-IR, XRD and VSM. The surfaces of Fe3O4 particles were coated with SiO2 to obtain Fe3O4@SiO2 particles, with high dispersibility. Fe3O4@SiO2 particles could be used repeatedly for plasmid DNA extraction leading to reduced costs. Plasmid DNA on Fe3O4@SiO2 could be used as DNA templates for PCR.
Key words: dynamic reactor    superparamagnetic Fe3O4 particles    Fe3O4@SiO2    DNA extraction    reutilization    
引言

超顺磁性Fe3O4粒子是一种安全性高、生物相容性好的介质材料,目前被广泛应用于酶的固定化、生化分离等[1-2]生物工程领域,以及免疫监测、核磁成像、抗菌、抗癌等[3-5]生物医学领域,此外,其在环保领域也有巨大的应用潜力[6-8]

研究者们对铁基磁性粒子的合成方法进行了大量研究[9-12],其中溶剂热法因反应条件简单、尺寸及形貌可控、结晶好、饱和磁化强度高,并且容易实现物化性能的改进而受到关注[11-12]。目前文献报道的溶剂热法大都是用静态反应釜合成超顺磁性Fe3O4粒子,因传热传质影响导致放大困难,所以大都使用100~200 mL的小容积反应釜,合成量低且成本高,难以满足实验和市场的需要。此外,出于DNA分子分离提取自动化和高通量快速提取的需要,对超顺磁Fe3O4@SiO2粒子的需求量日益增加,有关其制备及核酸提取等方面的研究仍在持续进行中[13-16]

本文通过溶剂热法使用动态反应釜制备超顺磁性Fe3O4粒子,为动态反应放大奠定基础;将动态反应合成的Fe3O4粒子表面包覆SiO2,以获得具有良好分散性的Fe3O4@SiO2粒子用于质粒DNA的提取,并对其可重复利用性进行研究。

1 实验部分 1.1 实验原料和仪器 1.1.1 实验原料

六水合氯化铁(FeCl3·6H2O)、醋酸钠(NaAc)、氯化钠(NaCl)、乙二胺四乙酸二钠(EDTANa2)、聚乙二醇(PEG)4000、PEG 8000、乙二醇、三羟甲基氨基甲烷(TriS),国药集团化学试剂有限公司;NaOH、正硅酸乙酯(TEOS)、无水乙醇、乙酸钾(KAc),25.0%~28.0%的氨水,北京化工厂;TritonX-100,≥90.0%,北京拜尔迪生物技术有限公司。以上试剂均为分析纯。

E. coli pUC-18为实验室保藏菌种,E. coli pUC-18-PT7-EGFP-TT7(1)为本校其他课题组提供;PCR上游引物序列为TTTGATTCGGTAATCTCCGAAC,下游序列为TTACCTCACTCATTAGGCACCC,生工生物(上海)股份有限公司;2×Taq PCR Mix,RNA酶A,北京拓英坊生物有限公司。

1.1.2 实验仪器

LEO-1530型扫描电子显微镜(SEM),英国Oxford公司;JEM-2100F型电子透射显微镜(TEM), 日本电子株式会社;7410型振动样品磁强计(VSM),美国Lake Shore公司;3100型傅里叶红外光谱仪(FT-IR),美国Varian公司;D/max-Ultima Ⅲ型X射线衍射仪(XRD),日本Rigaku公司;BioDoc 2 ItTM紫外成像系统,英国UVP公司;K5500型微量分光光度计,北京奥凯科技发展有限公司。

1.2 试剂配制

溶液Ⅰ、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ、TE缓冲液及PEG结合液的配制方法与文献[17]一致。

溶液Ⅰ   25 mmol/L Tris-HCl (pH 8.0)、10 mmol/L EDTA (pH 8.0)、50 mmol/L葡萄糖,121 ℃下高压灭菌15 min,4 ℃保存备用。

溶液Ⅱ   使用前配制0.2 mol/L NaOH、1% SDS。

溶液Ⅲ   3 mol/L醋酸钾缓冲液(KAc,pH 5.2),4 ℃保存备用。

TE缓冲液  10 mmol/L Tris-HCl(pH8.0)、1 mmol/L EDTA(pH8.0),121 ℃下高压湿热灭菌20 min,4 ℃保存备用。

PEG结合液  2 mol/L NaCl,20% PEG8000,4 ℃保存备用。

1.3 实验方法 1.3.1 超顺磁性Fe3O4粒子的制备

称取一定量的FeCl3·6H2O置于乙二醇溶液中,搅拌直至完全溶解,再加入一定量的无水NaAc、PEG4000,常温下继续剧烈搅拌30 min,然后将混合液体转入动态反应釜中,在一定的搅拌速率和反应温度下连续反应8 h。将反应产物在磁场条件下进行分离,将得到的固体粉末分别用去离子水和无水甲醇反复洗涤3~5次,置于真空干燥箱中50 ℃干燥6 h,即可得到超顺磁性Fe3O4粒子。

1.3.2 Fe3O4@SiO2粒子的制备

采用Stöber法制备Fe3O4@SiO2粒子[18]。称取Fe3O4粒子4.0 g,加入一定量的TEOS和8 mL Triton X-100超声分散2 min,再加入250 mL去离子水,超声分散20 min,转移至1 L圆底烧瓶,向其中加入100 mL氨水和250 mL无水乙醇,在室温条件下以一定速率搅拌反应4 h。停止搅拌,用去离子水和乙醇分别清洗数次,磁性分离,60 ℃真空干燥6 h,得到Fe3O4@SiO2复合粒子。

1.3.3 Fe3O4@SiO2磁性粒子提取质粒DNA

E. coli pUC-18接种于LB液体培养基,37 ℃培养过夜。摇匀培养基,吸取1.5 mL置于1.5 mL离心管中,以离心力10 600 g离心1 min, 收集菌体。加入预冷的250 μL溶液Ⅰ(含RNA酶A),用微量移液器反复吸打,进行菌体重悬浮,室温条件下静置5 min;加入等体积的溶液Ⅱ,温和反复颠倒2~3次,混匀,静置5 min;再加入等体积溶液Ⅲ,温和反复颠倒2~3次混匀,10 600 g离心5 min,弃沉淀。取400 μL上清液至另一支离心管中,加入50 μL自制的Fe3O4@SiO2磁性粒子(溶液Ⅰ配制,100 mg/mL)悬液,再加入400 μL PEG结合液,混匀,静置5 min。磁性分离,用500 μL 70%乙醇洗涤磁性粒子2次,60 ℃烘箱中放置10 min挥去乙醇,用50 μL TE缓冲液(pH 8.0)洗脱。含DNA分子的TE缓冲液用于琼脂糖凝胶电泳。洗脱DNA后的Fe3O4@SiO2再次用于质粒DNA提取。

E. coli pUC-18-PT7-EGFP-TT7(1)用上述同样方法进行质粒DNA提取,但质粒DNA吸附到Fe3O4@SiO2上后,一部分不经TE缓冲液洗脱(即Fe3O4@SiO2@DNA)直接用作聚合酶链式反应(PCR)扩增模板,另一部分用TE缓冲液洗脱后再次用于质粒DNA吸附。PCR扩增反应体系为ddH2O 23 μL、2×Taq PCR Mix 25 μL、上游引物1 μL、下游引物1 μL,混匀,用枪头沾取些许Fe3O4@SiO2@DNA加入上述反应体系中。置PCR仪上94 ℃预变性5 min后进入扩增循环阶段:94 ℃变性0.5 min、55 ℃退火3 min、72 ℃延伸1.5 min,循环33次;72 ℃保温7 min,4 ℃保存。

1.3.4 质粒DNA琼脂糖凝胶电泳

取6 μL提取质粒DNA溶液或PCR扩增产物与2 μL 6×上样缓冲液混匀,上样0.8%琼脂糖凝胶上样孔,100 V电泳50 min。取下凝胶,通过凝胶成像系统观察电泳结果。

2 结果与讨论 2.1 Fe3O4磁性粒子的制备与表征结果

通过对反应底物FeCl3·6H2O的加入量、反应时间、反应温度、反应釜搅拌速率等条件优化,获得最佳的反应条件为:1.6 L乙二醇中FeCl3·6H2O、PEG4000、NaAc加入量分别为35 g、25 g、90 g,反应温度200 ℃,时间10 h,反应釜的搅拌速率450 r/min。通过SEM图(图 1(a)(b))可知,得到的磁性粒子粒径约200 nm,并具有良好的分散性和均一性。该粒径小于本实验室用100 mL静态反应釜制备的超顺磁性Fe3O4粒子(粒径400 nm左右)[1],制备量也从0.4~0.5 g提高到8~10 g,单次单釜制备量提高近20倍。

图 1 Fe3O4粒子SEM图及其放大图 Fig.1 SEM and enlarged SEM images of Fe3O4 particles

通过XRD对Fe3O4粒子进行表征的结果如图 2所示。可以看出,谱图中出现220、311、400、422、511及440晶面峰,无其他杂峰,结晶良好,为反尖晶石结构,与Fe3O4标准卡片(JCPDS 79-4019)一致,也与本课题组通过静态反应釜合成的Fe3O4粒子晶体结构相同[1]

图 2 Fe3O4粒子XRD图 Fig.2 XRD pattern of Fe3O4 particles

图 3为VSM测试得到的Fe3O4粒子磁化曲线。可以看出,Fe3O4粒子的饱和磁化强度达到86 emu/g,具有较小的矫顽力(44.4 G)和剩磁(12.8 emu/g)。说明合成的Fe3O4粒子磁响应性能良好,并具有超顺磁性,即在无磁场条件下粒子可分散在反应体系中,在有磁场条件下可以方便地从分散体系中分离。

图 3 Fe3O4粒子磁化曲线 Fig.3 Magnetization curves of Fe3O4 particles
2.2 Fe3O4@SiO2粒子的表征结果及其DNA分离

以TEOS为原料通过聚合反应生成SiO2,形成的Fe3O4@SiO2容易团聚,影响其分散性。本文实验表明将搅拌速率提高到600 r/min,可获得到具有核壳结构、分散性良好的Fe3O4@SiO2粒子(图 4(a)(b)),SiO2壳层厚度约为20 nm(图 4(c))。

图 4 Fe3O4@SiO2的SEM图及其放大图与TEM图 Fig.4 SEM, enlarged SEM and TEM images of Fe3O4@SiO2 particles

图 5为Fe3O4和Fe3O4@SiO2的FT-IR谱图,其中590 cm-1左右为Fe3O4中Fe—O键的吸收峰,3 400 cm-1和1 600 cm-1处附近分别为O—H键的伸缩振动峰和弯曲振动峰;而1 100 cm-1附近为Si—O键的吸收峰,进一步说明SiO2包覆在Fe3O4表面[14-15]

图 5 Fe3O4和Fe3O4@SiO2的FT-IR谱图 Fig.5 FT-IR spectra of Fe3O4 and Fe3O4@SiO2

将Fe3O4@SiO2粒子作为介质进行质粒DNA提取分离。吸附了质粒DNA的Fe3O4@SiO2粒子用TE缓冲液洗脱后,再次用于质粒DNA的提取,共使用9个批次,将得到的质粒DNA溶液进行琼脂糖凝胶电泳,结果见图 6

M—DNA Marker; 1~9—不同提取批次;10—商品试剂盒。 图 6 Fe3O4@SiO2分离提取质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图 Fig.6 Agarose gel electrophoresis of plasmid DNA isolated using Fe3O4@SiO2

图 6可知,Fe3O4@SiO2可反复用于E. coli质粒DNA提取,但随着使用批次的增加,对应条带变暗,提取量有下降的趋势。对各批次进行DNA浓度测定(表 1),可以看出随着提取批次增加,DNA提取量降低,与电泳结果一致。但各批次提取浓度均在100 ng/mL以上,并且各个批次的A260/A280值大都接近或高于1.8,说明所提取的质粒DNA无蛋白质污染,提取效果较好。由此可以表明,Fe3O4@SiO2对于DNA提取分离具有较好的可重复利用性,此结果在其他文献中尚未见有报道。

下载CSV 表 1 Fe3O4@SiO2提取各批次质粒DNA的浓度及A260/A280 Table 1 The concentration and A260/A280 of plasmid DNA in different batches of Fe3O4@SiO2

研究发现,质粒DNA不经洗脱吸附在Fe3O4@SiO2上作模板, 即将Fe3O4@SiO2@DNA直接加至PCR反应体系中进行PCR扩增,重复吸附9个批次均获得相同的DNA条带,并与预期设计结果一致(图 7)。该结果说明Fe3O4@SiO2对PCR扩增无抑制作用,Fe3O4@SiO2@DNA上的DNA无需洗脱分离,可直接作为PCR扩增模板,从而减少了DNA分离提取步骤。

M—DNA Marker;1~9— Fe3O4@SiO2@DNA;10—Fe3O4@SiO2 图 7 质粒DNA吸附到Fe3O4@SiO2为模板PCR产物电泳图 Fig.7 PCR electropherogram of Fe3O4@SiO2@DNA
3 结论

通过底物添加量、搅拌桨搅拌速率、温度等条件的优化,用动态反应釜放大获得粒径均一、单分散的超顺磁性Fe3O4粒子,制备量达8~10 g,为Fe3O4的放大制备奠定了基础。对获得的Fe3O4粒子进行SiO2修饰,制备出分散性良好的Fe3O4@SiO2磁性粒子并用于质粒DNA提取,发现Fe3O4@SiO2提取DNA具有良好的可重复利用性,降低了使用成本;DNA可与分离介质Fe3O4@SiO2一起加至PCR扩增反应体系作模板,实现正常的PCR反应。

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